10x Multiome ATAC + Gene Expression
服務(wù)簡(jiǎn)介
隨著單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)快速普及，僅僅是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組層面已經(jīng)不足以全面解決問題，因?yàn)樵诟叨葏f(xié)調(diào)的生物系統(tǒng)中，從基因到轉(zhuǎn)錄本再到蛋白會(huì)受到各種途徑的調(diào)控，包括表觀基因組調(diào)控和各種DNA/RNA修飾的調(diào)控，因此結(jié)合scATAC可以分析單細(xì)胞級(jí)別的染色質(zhì)可及性，結(jié)合單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)可以分析細(xì)胞內(nèi)部和細(xì)胞表面的蛋白質(zhì)表達(dá)情況，有助于深入認(rèn)知各種生理現(xiàn)象背后的機(jī)制。
產(chǎn)品提供了一種綜合的、可伸縮的多組學(xué)方法，用于檢測(cè)同一單個(gè)細(xì)胞核中的轉(zhuǎn)錄組信息和染色質(zhì)可及性信息。與獨(dú)立的Chromium Next GEM單細(xì)胞ATACv1.1和Chromium Next GEM單細(xì)胞基因表達(dá)v3.1分析相比，這種多組學(xué)方法提供了一種可同時(shí)獲取同一個(gè)單細(xì)胞的基因組開放數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組表達(dá)水平數(shù)據(jù)的技術(shù)，從而使研究人員可以將不同生物事件中的各種單細(xì)胞的基因組染色質(zhì)開放信息與基因表達(dá)程度進(jìn)行準(zhǔn)確關(guān)聯(lián)，以便更好地在細(xì)胞和分子水平上對(duì)發(fā)育遺傳學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、免疫組學(xué)、腫瘤和其它疾病機(jī)理等關(guān)鍵生命科學(xué)領(lǐng)域開展深入研究。
技術(shù)路線
為同時(shí)獲得同一細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和表觀組，首先利用Tn5轉(zhuǎn)座酶對(duì)細(xì)胞核懸液進(jìn)行核DNA轉(zhuǎn)座，Tn5轉(zhuǎn)座酶優(yōu)先切割開放染色質(zhì)區(qū)域中的核DNA。然后利用Chromium平臺(tái)進(jìn)行單細(xì)胞基因表達(dá)（GEX）和ATAC文庫(kù)制備，該過程將單個(gè)細(xì)胞核、反應(yīng)試劑與單個(gè)凝膠珠（Gel Bead）包裹成液滴（GEM）。凝膠珠同時(shí)包括帶有特異性條形碼、唯一分子標(biāo)識(shí)符（UMI）的poly(dT)序列和帶有10x Barcode的Spacer序列，poly(dT)序列能夠捕獲具有poly(dA)尾的mRNA用于生成基因表達(dá)（GEX）文庫(kù)，Spacer序列能夠?qū)l形碼添加到轉(zhuǎn)座的DNA片段上生成ATAC文庫(kù)。對(duì)得到的兩種文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序，并將來自同一細(xì)胞兩種文庫(kù)的測(cè)序數(shù)據(jù)通過10x Barcode匹配，即可實(shí)現(xiàn)同時(shí)對(duì)同一細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和表觀組進(jìn)行關(guān)聯(lián)。
應(yīng)用領(lǐng)域
發(fā)育遺傳學(xué)
神經(jīng)科學(xué)
免疫組學(xué)
腫瘤
其它疾病機(jī)理
儀器設(shè)備
10x Genomics Chromium X Series
廣科安德可提供單細(xì)胞/空間組、基因組、表觀組、微生物組、蛋白質(zhì)組、代謝組等多組學(xué)測(cè)序和生物信息學(xué)分析服務(wù)，從基礎(chǔ)研究、轉(zhuǎn)化研究到臨床應(yīng)用提供全方位科研技術(shù)服務(wù)及解決方案歡迎免費(fèi)咨詢，了解更多詳細(xì)信息!我們的技術(shù)專員可免費(fèi)為您提供業(yè)務(wù)評(píng)估。
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